A coleta convencional é feita pela empresa Transresíduos, que recolhe o lixo misturado dos moradores de porta em porta. Em locais de difícil acesso aos caminhões coletores, os garis coletam a pé ou são disponibilizados contentores. Todo o resíduo misturado é destinado ao Aterro Sanitário Municipal de São Bento do Sul, localizado no Rio Vermelho.

A coleta seletiva é feita pela Cooperativa de Catadores Copercat SBS, que recebe os materiais recicláveis secos (papéis, plásticos, vidros e metais) doados pelos moradores. A coleta seletiva é feita uma vez por semana na maioria dos bairros. Os moradores devem separar os materiais recicláveis dos orgânicos e colocá-los em sacos ou caixas diferentes. Os materiais recicláveis são levados para a cooperativa, onde são triados, prensados e vendidos para indústrias recicladoras.

A coleta de lixo domiciliar do SAMAE de São Bento do Sul tem como objetivos reduzir a quantidade de resíduos enviados ao aterro, aumentar a vida útil do aterro, gerar renda e trabalho para os catadores, preservar os recursos naturais e conscientizar a população sobre a importância da reciclagem.